ESIINE comprende 5 líneas de investigación que dan lugar a rutas específicas de investigación y/o de especialización. Cada línea de investigación es implementada por una o varias universidades asociadas. Esto permite no solo diversidad de enfoques, sino también fortalecimiento de las especificidades de cada uno de los programas y universidades participantes.

Las y los doctorantes tienen la posibilidad de trabajar una o más líneas de investigación de acuerdo a sus intereses y a la pertinencia de estas para sus proyectos de doctorado.

Líneas de investigación:

1. Epistemologías, metodologías y nuevos saberes.

2. Desigualdad, género, etnicidad y exclusión social.

3. Cuerpo, saberes y tecnologías.

4. Procesos sociales y culturales: subjetividad, institucionalidad y políticas.

5. Representaciones sociales y culturales. Medios de comunicación y discursos.